双极膜电渗析是在双极膜水解离器和普通电渗析原理的基础上发展起来的，它是以双极膜代替普通电渗析的部分阴、阳膜或者在普通电渗析的阴、阳膜之间加上双极膜构成的。

双极膜电渗析的最基本应用是从盐溶液(MX)制备相应的酸(HX)和碱(MOH)。在直流电场的作用下，盐阴离子 (X^-) 通过阴离子交换膜进入酸室，并与双极膜离解的氢离子生成酸 (HX)；而盐阳离子(M⁺) 通过阳离子交换膜进入碱室，在那里与双极膜离解的氢氧根离子形成碱(MOH):

双极膜电渗析主要应用于食品工业、水处理、环境保护、医药化工、生物化工、化工生产等领域。